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人全基因组重测序数据分析

人全基因组测序数据标准分析1.测序数据比对QC,平均覆盖乘数 2.细胞突变和插入、缺失3. 结构变异、移位、大片段插入缺失4. 体细胞拷贝数变异5.基因组改变的功能注释,突变危害性预测

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全基因组甲基化测序

全基因组DNA甲基化测序(WGBS)是 DNA 甲基化研究的金标准,它通过 Bisulfite 处理和全基因组 DNA 测序结合的方式,对整个基因组上的甲基化情况进行分析,具有单碱基分辨率。

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第一代测序分析

 1. Shutgun测序  2. EST/cDNA测序  3. PCR重测序  4. 序列NCBI批量递交

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转录组测序(RNA-seq)服务(illumina solexa高通量测序)

可对高通量测序结果进行进一步的生物信息学分析,包括基因组、转录组、small RNA等测序后分析

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RNA-seq 数据分析

RNA-seq当前应用比较广的是mRNA测序与非编码RNA测序。

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表达谱芯片分析

芯片数据预处理 ,统计学分析,聚类分析,GO分析,Pathway分析

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